L'histoire du temps de guerre dans les Orcades est fortement représentée dans le musée alors qu'au nez et à la barbe du public un intense réseau de communications comprenant radios et téléphones était en opération pour protéger la Flotte métropolitaine à Scapa Flow. Une station radar a été installée à Netherbutton dans les Orcades et équipée avec du matériel top secret. Les objets que vous pourrez voir dans la section temps de guerre sont des transmetteurs utilisés pour parler à courte distance aux combattants et à longue distance en morse aux bombardiers, réplique d'équipement radar, carte originale des opérations d'armement menées par le quartier général de Kirkwall, émetteurs et receveurs de bombardier, images, documents, et le diagramme original de l'obstruction littorale de Scapa Flow.